Αναπτυξιακή μοριακή βιολογία φυτών

 

ΠΡΟΗΓΟΥΜΕΝΗ ΕΚΔΟΣΗ, ΔΕΙΤΕ ΤΗ ΝΕΟΤΕΡΗ ΕΚΔΟΣΗ ΕΔΩ: https://embryopub.gr/index.php?target=products&product_id=3742

Αναπτυξιακή μοριακή βιολογία φυτών

Κρίτων Καλαντίδης
Επίκ. καθηγητής, Πανεπιστήμιο Κρήτης, Τμήμα Βιολογίας

Δήμητρα Μηλιώνη
Επίκ. καθηγήτρια, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών, Τμήμα Βιοτεχνολογίας

Καλλιόπη Παπαδοπούλου
Επίκ. καθηγήτρια, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας

Σταμάτης Ρήγας
Λέκτορας, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών, Τμήμα Βιοτεχνολογίας

Ανδρέας Ρούσσης
Επίκ. καθηγητής, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο, Τμήμα Βιολογίας

Κοσμάς Χαραλαμπίδης
Επίκ. καθηγητής, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο, Τμήμα Βιολογίας

Πολυδεύκης Χατζόπουλος
Καθηγητής, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών, Τμήμα Βιοτεχνολογίας

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ

1 Εισαγωγικές έννοιες
1.1. Η Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗ ΤΩΝ ΦΥ­ΤΩΝ
1.1.1. Α­νά­πτυ­ξη του γα­με­τό­φυ­του
1.1.2. Α­νά­πτυ­ξη του σπο­ριό­φυ­του (εμ­βρυογέ­νε­ση)
1.1.3. Βλά­στη­ση – Πρω­το­γε­νής και δευ­τε­ρο­γε­νής α­νά­πτυ­ξη
1.2. ΣΥ­ΝΤΟ­ΝΙ­ΣΜΟΣ ΤΗΣ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗΣ ΣΤΑ ΦΥ­ΤΑ
1.3. ΜΟ­ΡΙΑ ΣΙ­ΝΙΑ­ΛΑ ΣΤΗΝ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗ ΤΩΝ ΦΥ­ΤΩΝ
1.4. ΠΡΟ­ΓΡΑΜ­ΜΑ­ΤΙ­ΣΜΕ­ΝΟΣ ΚΥΤ­ΤΑ­ΡΙ­ΚΟΣ ΘΑ­ΝΑ­ΤΟΣ ΣΤΑ ΦΥ­ΤΑ (PCD)
ΒΙ­ΒΛΙΟ­ΓΡΑ­ΦΙΑ

2 Γονιδιωματική των Ανώτερων Φυτών
2.1. ΠΕΡΙ ΔΟΜΗΣ ΤΟΥ ΦΥΤΙΚΟΥ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΟΣ
2.1.1. Η ποσότητα του DNA
2.1.2. Χρωμοσωματικές διαφοροποιήσεις και αποκλίσεις
2.1.3. Προέλευση της μεταβλητότητας του DNA
2.1.4 Μηχανισμοί που επηρεάζουν το μέγεθος του γονιδιώματος
2.1.5. Επιπτώσεις των πολλαπλών γονιδιωμάτων
2.2. Η ΒΑΣΙΚΗ «ΕΡΓΑΛΕΙΟΘΗΚΗ» ΤΗΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗΣ. EΞΑΓΩΓΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΣ ΑΠΟ ΤΟ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑ - ΚΑΤΑΤΜΗΣΗ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΩΝ ΚΑΙ ΒΙΒΛΙΟΘΗΚΕΣ
2.2.1. Οι μεθοδολογίες απομόνωσης και κλασμάτωσης των γονιδιωμάτων
2.2.1.1. Συστήματα κλωνοποίησης
2.2.1.2. Πλασμιδιακοί φορείς
2.2.1.3. Φορείς μεγάλων ενθέσεων
2.2.2. BACs και Φυσικοί Χάρτες (Physical maps)
2.2.3. BACs και Ολιγονουκλεοτίδια Overgo
2.2.4. Κλωνοποίηση cDNA
2.2.4.1. Αλληλούχιση με χρήση μεταθετών στοιχείων
2.2.4.2. Αλληλούχιση «πολυμερισμένων» cDNA, CCS
2.2.4.3. Αλληλούχιση με διαδοχικούς εκκινητές - “Primer Walking”
2.2.5. Διαφορική Απεικόνιση –« Differential Display»
2.2.5.1 Μικροσυστοιχίες DNA - «DNA Microarrays»
2.2.5.2. Γενικά χαρακτηριστικά των μικροσυστοιχιών
Παραλληλία
Μικροσκοπικοποίηση
Multiplexing
2.2.5.3. Τεχνολογία των μικροσυστοιχιών
Φωτολιθογραφία
Μηχανική μικροακινητοποίηση (microspotting)
Τεχνολογία ψεκασμού (inkjet)
2.2.5.4. DNA Μικροσυστοιχίες και φυτά
Ανάλυση της γονιδιακής έκφρασης
Μικροσυστοιχίες και miRNA
2.3. ΜΟΡΙΑΚΟΙ ΧΑΡΤΕΣ
2.4. ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΜΟΡΙΑΚΩΝ ΔΕΙΚΤΩΝ
2.4.1. RFLPs – «Πολυμορφισμός Μήκους Θραυσμάτων»
2.4.2. RAPDs - «Ενίσχυση Τυχαίου Πολυμορφικού DNA»
2.4.3. Sequence-Tagged Sites (STS) – «Μικροπινακίδες αλληλουχιών»
2.4.3.1. Microsatellites – «Μικροδορυφόροι»
2.4.3.2. Sequence Characterized Amplified Region (SCAR)
2.4.3.3. Cleaved Amplified Polymorphic Sequences (CAPS)
2.4.3.4. Inter-simple Sequence Repeats (ISSRs) – «Ενδο-μικροδορυφορικές επαναλήψεις»
2.4.4. Στόχευση επαγόμενων μεταλλάξεων σημείου στο γονιδίωμα (Targeting Induced Local Lesions IN Genomes -TΙLLING)
2.4.5. AFLPs
2.4.6. Κλασμάτωση γονιδιωμάτων
2.4.6.1. Βιβλιοθήκες με «Φιλτράρισμα μεθυλίωσης» - MF (Methyl-Filtration)
2.4.6.2. Βιβλιοθήκες Hi Cot
2.4.6.3. Συνδυασμός βιβλιοθηκών HC και ΜF
2.4.6.4. Βιβλιοθήκες από πέψη με ενδονουκλέασες ευαίσθητες στη μεθυλίωση (ΗΜPR)
2.4.6.5. Transposon Insertion Site Sequence
2.4.7. Expressed Sequence tags (ESTs) «Ετικέττες Μεταγραφόμενων Ακολουθιών»
ΒΙ­ΒΛΙΟ­ΓΡΑ­ΦΙΑ
3 Μεθοδολογία στη μελέτη ανάπτυξης των φυτών

3.1 ΕΙ­ΣΑ­ΓΩ­ΓΗ
3.2. ΠΡΟ­ΤΥ­ΠΑ ΜΟ­ΝΤΕ­ΛΑ ΣΤΗ ΜΕ­ΛΕ­ΤΗ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗΣ ΤΩΝ ΦΥ­ΤΩΝ
3.2.1. Zea mays
3.2.2. Arabidopsis thaliana
3.3. ΤΟ AGROBACTERIUM TUMEFACIENS
3.3.1 Γε­νι­κά
3.3.2. Αλ­λη­λε­πί­δρα­ση φυ­τού – Αgrobacterium tumefaciens
3.3.3. Δρά­ση των γο­νι­δί­ων vir
3.3.4. Χρή­ση του συ­στή­μα­τος του Agrobacterium tumefaciens
3.4. ΓΟ­ΝΙ­ΔΙΑ «ΜΑΡ­ΤΥ­ΡΕΣ» (REPORTER GENES)
3.5. ΠΡΟ­ΣΕΓ­ΓΙ­ΣΕΙΣ ΜΟ­ΡΙΑ­ΚΗΣ ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗΣ ΦΥ­ΤΩΝ
3.5.1. «Προς τα ε­μπρός γε­νε­τι­κή» (forward genetics): Εύ­ρε­ση με­ταλ­λαγ­μέ­νων σειρών με συ­γκε­κρι­μέ­νο φαι­νό­τυ­πο
3.5.2. «Α­ντί­στρο­φη γε­νε­τι­κή» (Reverse Genetics): Εύρε­ση του με­ταλ­λαγ­μέ­νου φαι­νό­τυ­που για έ­να «γο­νί­διο στό­χο»
3.5.2.1. Στο­χευ­μέ­νη με RNAi «α­ντί­στρο­φη γε­νε­τι­κή»: Δη­μιουρ­γί­α δια­γο­νι­δια­κών σειρών με­τα-με­τα­γρα­φι­κής γο­νι­δια­κής σίγη­σης (RNA gene silencing) για συ­γκεκρι­μέ­νο γο­νί­διο
3.5.2.2. «Στό­χευ­ση ε­πα­γό­με­νων με­ταλ­λά­ξε­ων ση­μεί­ου στο γο­νι­δί­ω­μα» (Targeting Induced Local Lesions IN Genomes - TILLING)
3.6. ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗ Α­ΝΑ­ΛΥ­ΣΗ ΜΕ­ΤΑΛ­ΛΑΓ­ΜΕ­ΝΩΝ ΣΕΙΡΩΝ
3.6.1. Γε­νε­τι­κές δια­σταυ­ρώ­σεις
3.6.2. Ε­πα­να­δια­σταύ­ρω­ση και συ­γκλη­ρο­νο­μι­κότη­τα
3.6.3. Α­νά­λυ­ση διά­σχι­σης
3.6.4. Έ­λεγ­χος συ­μπλη­ρω­μα­τι­κό­τη­τας
3.6.5. Δη­μιουρ­γί­α και α­να­γνώ­ρι­ση διπλών και τρι­πλών με­ταλ­λαγ­μά­των (double and triple mutants)
3.7. ΦΑΙ­ΝΟ­ΤΥ­ΠΙ­ΚΗ Α­ΝΑ­ΛΥ­ΣΗ ΜΕ­ΤΑΛ­ΛΑΓ­ΜΕΝΩΝ ΣΕΙΡΩΝ
3.7.1. Πα­ρά­με­τροι αύ­ξη­σης
3.7.2. Ορ­μο­νι­κή α­πό­κρι­ση
3.7.3. Α­πό­κρι­ση σε α­βιο­τι­κά ε­ρε­θί­σμα­τα
3.7.4. Βα­κτη­ρια­κά και ω­ο­μυ­κη­τια­κά πα­θο­γό­να
3.7.5. Ι­στο­λο­γι­κές α­να­λύ­σεις και ει­δι­κές χρώ­σεις
3.7.6. Τε­χνι­κές προ­ηγ­μέ­νης μι­κρο­σκο­πί­ας
3.8. Α­ΠΟ­ΜΟ­ΝΩ­ΣΗ ΓΟ­ΝΙ­ΔΙΟΥ ΠΟΥ ΣΧΕ­ΤΙ­ΖΕΤΑΙ ΜΕ ΜΙΑ ΜΕ­ΤΑΛ­ΛΑ­ΞΗ
3.8.1. Ε­ντο­πι­σμός του με­ταλ­λαγ­μέ­νου γονι­δί­ου σε σειρές «έν­θε­σης»
3.8.2. Ε­ντο­πι­σμός του με­ταλ­λαγ­μέ­νου γο­νι­δί­ου με τη με­θο­δο­λο­γί­α της «κλω­νο­ποί­η­σης/χαρτογράφησης θέ­σης»
3.9. ΜΕ­ΛΕ­ΤΗ ΤΗΣ ΕΚ­ΦΡΑ­ΣΗΣ Ε­ΝΟΣ ΓΟ­ΝΙ­ΔΙΟΥ ΚΑΙ ΤΗΣ ΛΕΙ­ΤΟΥΡ­ΓΙΑΣ ΤΗΣ Α­ΝΤΙ­ΣΤΟΙ­ΧΗΣ ΠΡΩ­ΤΕΪΝΗΣ
3.9.1. Με­λέ­τη της πο­σο­τι­κής και το­πολο­γι­κής έκ­φρα­σης ε­νός γο­νι­δί­ου και της 5΄ ρυθ­μι­στι­κής πε­ριο­χής του
3.9.2. Με­λέ­τες πρω­τε­ϊ­νών
3.9.3. Με­λέ­τες πρω­τε­ϊ­νι­κών αλ­λη­λε­πι­δρά­σε­ων
ΒΙ­ΒΛΙΟ­ΓΡΑ­ΦΙΑ

4 Ενδογενής και εξωγενής πληροφορία
4.1. ΣΧΕ­ΣΗ ΜΕΤΑ­ΞΥ «ΚΑ­ΤΑ­ΓΩ­ΓΗΣ» ΚΑΙ «ΘΕ­ΣΗΣ» ΣΤΟΝ ΚΑ­ΘΟ­ΡΙ­ΣΜΟ ΤΗΣ ΚΥΤ­ΤΑ­ΡΙ­ΚΗΣ «ΤΥ­ΧΗΣ»
4.2. «ΚΑ­ΤΑ­ΓΩ­ΓΗ» ΚΑΙ «ΤΥ­ΧΗ» ΤΩΝ ΚΥΤ­ΤΑ­ΡΩΝ ΣΕ ΔΙΑ­ΦΟ­ΡΟΥΣ Ι­ΣΤΟΥΣ
4.3. ΠΑ­ΡΑ­ΔΕΙΓ­ΜΑ­ΤΑ Α­ΝΑ­ΠΤΥΞΙΑ­ΚΟΥ ΠΡΟ­ΤΥ­ΠΟΥ «ΚΑ­ΤΑ­ΓΩ­ΓΗΣ» ΚΑΙ «ΘΕ­ΣΗΣ»
4.3.1. Α­δρα­νοποί­η­ση κυτ­τά­ρων α­κραί­ου με­ρι­στώ­μα­τος ρί­ζας με λέ­ι­ζερ
4.3.2. Πρά­σι­νες-ά­σπρες-πρά­σι­νες πε­ρι­κλι­νείς χί­μαι­ρες
4.3.3. Μεταλ­λά­ξεις που ε­πη­ρε­ά­ζουν το πρό­τυ­πο των κυτ­τα­ρι­κών διαι­ρέ­σε­ων
4.3.4. Το πρό­τυ­πο α­νά­πτυ­ξης των τρι­χι­δί­ων στα φύλ­λα του Arabidopsis
4.3.5. Το πρό­τυ­πο δια­φο­ρο­ποί­η­σης των ρι­ζι­κών τρι­χι­δί­ων στο Arabidopsis
4.3.6. Το πρό­τυ­πο α­νά­πτυ­ξης των φύλλων (φυλ­λο­τα­ξί­α) στο Arabidopsis
4.3.7. Συ­ντο­νι­σμέ­νη α­νά­πτυ­ξη φύλ­λου και αγ­γεια­κού συ­στή­μα­τος
4.4. ΣΧΕ­ΣΗ ΜΕ­ΤΑ­ΞΥ «Η­ΛΙ­ΚΙΑΣ» ΚΑΙ «ΘΕ­ΣΗΣ» ΣΤΟΝ ΚΑ­ΘΟ­ΡΙ­ΣΜΟ ΤΗΣ ΚΥΤ­ΤΑ­ΡΙ­ΚΗΣ «ΤΥ­ΧΗΣ»
4.4.1. Με­ταλ­λά­ξεις που ε­πη­ρε­ά­ζουν το ρυθ­μό έ­ναρ­ξης σχη­μα­τι­σμού των φύλ­λων στο Arabidopsis ...
ΒΙ­ΒΛΙΟ­ΓΡΑ­ΦΙΑ

5 Εμβρυογένεση
5.1 ΓΕ­ΝΙ­ΚΑ
5.2. ΤΑ ΕΜ­ΒΡΥΟ­ΓΕΝΕ­ΤΙ­ΚΑ ΣΤΑ­ΔΙΑ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗΣ
5.3. Ε­ΠΙ­ΔΡΑ­ΣΕΙΣ ΜΗ­ΤΡΙ­ΚΗΣ ΠΡΟ­Ε­ΛΕΥ­ΣΗΣ
5.3.1. Μη­τρι­κής προ­έ­λευ­σης πλη­ρο­φο­ρί­α α­πό το θη­λυ­κό σπο­ριό­φυ­το
5.3.2. Μη­τρι­κής προ­έ­λευ­σης πλη­ροφο­ρί­α α­πό το θη­λυ­κό γα­με­τό­φυ­το
5.4. ΜΟ­ΡΙΑ­ΚΗ ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗ ΤΗΣ ΕΜ­ΒΡΥΟΓΕ­ΝΕ­ΣΗΣ
5.4.1. Εμ­βρυο-θνη­σι­γό­νες με­ταλ­λαγ­μένες σειρές
5.4.2. Με­ταλ­λάγ­μα­τα εμ­βρυα­κού προ­τύ­που
5.4.3. Σχη­μα­τι­σμός του α­κραιο-βα­σικού προ­τύ­που (ά­ξο­να)
5.4.3.1. Σχη­μα­τι­σμός της α­κραιο-βασι­κής πο­λι­κό­τη­τας
5.4.3.2. Σχη­μα­τι­σμός της α­κραί­ας εμβρυακής δο­μής
5.4.3.3. Σχη­μα­τι­σμός της βα­σι­κής εμβρυακής δο­μής
5.4.3.4. Σχη­μα­τι­σμός του α­κτι­νω­τού προ­τύ­που (σχε­δί­ου)
5.4.3.5. Ο ρό­λος της αυ­ξί­νης στην ε­γκα­θί­δρυ­ση του εμ­βρυα­κού ά­ξο­να
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

6 Ανάπτυξη του βλαστού

6.1 ΓΕ­ΝΙ­ΚΑ
6.2. ΟΡ­ΓΑ­ΝΩ­ΣΗ ΤΟΥ Α­ΚΡΑΙΟΥ ΜΕ­ΡΙ­ΣΤΩ­ΜΑ­ΤΟΣ ΤΟΥ ΒΛΑ­ΣΤΟΥ
6.3. ΜΟ­ΡΙΑ­ΚΗ ΒΑ­ΣΗ ΤΗΣ ΔΗ­ΜΙΟΥΡ­ΓΙΑΣ ΚΑΙ ΔΙΑ­ΤΗ­ΡΗ­ΣΗΣ ΤΟΥ ΑΜ­Β
6.3.1. Υ­πεύ­θυ­να γο­νί­δια και το πρό­τυ­πο της έκ­φρα­σής τους
6.3.2. Το γο­νί­διο SHOOTMERISTEMLESS (STM)
6.3.3. Το γο­νί­διο ZWILLE (ZLL)
6.3.4. Το γο­νί­διο WUSCHEL (WUS)
6.3.5. Τα γο­νί­δια CLAVATA (CLV)
6.3.5.1. Το σύ­μπλο­κο των CLV υ­πο­δο­χέ­ων και η ρυθ­μι­στι­κή του δρά­ση
6.3.6. Αλ­λη­λε­πί­δρα­ση των ε­μπλε­κό­με­νων γο­νι­δί­ων
ΒΙ­ΒΛΙΟ­ΓΡΑ­ΦΙΑ

7 Ανάπτυξη του φύλλου
7.1. ΓΕ­ΝΙ­ΚΑ
7.2. Α­ΠΑΡΧΗ ΤΟΥ ΑΡΧΕΦΥΤΡΟΥ ΤΟΥ ΦΥΛΛΟΥ
7.3. ΕΓΚΑΘΙΔΡΥΣΗ ΑΞΟΝΙΚΗΣ ΠΟΛΙΚΟΤΗΤΑΣ (ΑΣΥΜΜΕΤΡΙΑΣ) (Αxial polarity)
7.3.1. Κα­θο­ρι­σμός πα­ρα­ξο­νι­κής ταυ­τό­τη­τας (adaxial identity)
7.3.2. Κα­θο­ρι­σμός της α­πα­ξο­νι­κής ταυ­τό­τη­τας
7.4. ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΟΥ ΠΕΡΙΘΩΡΙΟΥ ΤΟΥ ΦΥΛΛΟΥ
7.5. ΑΥΞΗΣΗ ΤΗΣ ΦΥΛΛΙΚΗΣ ΕΠΙΦΑΝΕΙΑΣ (ΕΛΑΣΜΑΤΟΣ)
7.6. ΕΛΕΓΧΟΣ ΤΟΥ ΣΧΗΜΑΤΟΣ ΤΟΥ ΦΥΛΛΟΥ
7.7. ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΣΤΟΜΑΤΩΝ
7.8. ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΡΙΧΙΔΙΩΝ ΦΥΛΛΟΥ
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

8 Ανάπτυξη του άνθους

8.1. ΟΙ ΔΥΟ ΒΑ­ΣΙ­ΚΕΣ ΑΡ­ΧΕΣ ΤΗΣ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗΣ ΤΟΥ ΑΝ­ΘΟΥΣ
8.2. ΓΟ­ΝΙ­ΔΙΑ ΠΟΥ Ε­ΜΠΛΕ­ΚΟ­ΝΤΑΙ ΣΤΗΝ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΗ ΤΟΥ ΑΝ­ΘΟΥΣ
8.2.1. Τα πολ­λα­πλά ε­πα­γω­γι­κά μο­νο­πά­τια που ε­λέγ­χουν το χρό­νο της άν­θη­σης - Γο­νί­δια χρό­νου άν­θη­σης (ΓΧΑ)
8.2.2. Τα «γο­νί­δια με­ρι­στω­μα­τι­κής ταυ­τό­τη­τας» (ΓΜΤ)
8.2.2.1. Ι­στο­ει­δι­κή, το­πο­λο­γι­κή έκ­φρα­ση και λει­τουρ­γι­κή αλ­λη­λε­πί­δραση των γο­νι­δί­ων LFY, AP1, και CAL
8.2.3. Τα «γο­νί­δια κα­θο­ρι­σμού της ταυ­τό­τη­τας των αν­θι­κών ορ­γά­νων» (ΓΑ­Ο), ή «γο­νί­δια ABC» - Το μο­ντέ­λο ABC
8.2.3.1. Σειρές με πολ­λα­πλές με­ταλ­λά­ξεις και δια­γο­νι­δια­κά φυ­τά με τρο­ποποι­η­μέ­νη έκ­φρα­ση των γο­νι­δί­ων ABC
8.2.3.2. Ε­γκα­θί­δρυ­ση του πρό­τυ­που δρά­σης των γο­νι­δί­ων της Β κλά­σης
8.2.3.3. Ε­γκα­θί­δρυ­ση του πρό­τυ­που δρά­σης των γο­νι­δί­ων της Α και C κλά­σης
8.2.4. Τρο­πο­ποί­η­ση του μο­ντέ­λου ABC - Τα γο­νί­δια SEPALLATA
8.2.5. Η πλειο­ψη­φί­α των γο­νιδί­ων ABCE κω­δι­κο­ποιεί για MADS με­τα­γρα­φι­κούς πα­ρά­γο­ντες
8.2.8. Τα miRNAs ως ρυθ­μι­στές του γο­νι­δί­ου AP2

9 Ανάπτυξη της ρίζας

9.1. ΕΙΣΑΓΩΓΗ
9.2. ΕΜΒΡΥΟΓΕΝΕΣΗ: Η ΕΝΑΡΞΗ ΤΗΣ ΖΩΗΣ
9.3. ΤΑ ΑΡΧΙΚΑ ΚΥΤΤΑΡΑ ΤΟΥ ΡΙΖΙΚΟΥ ΜΕΡΙΣΤΩΜΑΤΟΣ ΚΑΙ ΟΙ ΑΠΟΓΟΝΟΙ ΤΟΥΣ
9.4. ΑΝΑΤΟΜΙΑ ΠΡΩΤΟΓΕΝΟΥΣ ΡΙΖΑΣ
9.4.1. Κύ­ριες α­να­το­μι­κές ζώνες του ρι­ζι­κού συ­στή­μα­τος
9.4.2. Κυτ­τα­ρι­κή ορ­γά­νω­ση της ρί­ζας στο φυ­τό Arabidopsis
9.5. ΔΙΑΡΚΗΣ ΑΝΑΓΕΝΝΗΣΗ ΤΩΝ ΑΡΧΙΚΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ
9.6. ΣΗΜΑΣΙΑ ΤΗΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΗΣ ΘΕΣΗΣ ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΗΣ ΡΙΖΑΣ
9.7. Ο ΡΟΛΟΣ ΤΗΣ ΑΥΞΙΝΗΣ ΣΤΗΝ ΟΡΓΑΝΩΣΗ ΤΟΥ AMP
9.7. ΜΟΡΙΑΚΗ ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΤΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ ΤΗΣ ΡΙΖΑΣ
9.7.1. Οι μεταλ­λά­ξεις root meristemless-1 (rml-1) και root meristemless-2 (rml-2)
9.7.1.1. Φαι­νο­τυ­πι­κός χα­ρα­κτη­ρισμός των rml με­ταλ­λά­ξε­ων
9.7.1.2. Κυτ­τα­ρι­κές διαι­ρέ­σεις των rml με­ταλ­λαγ­μά­των
9.7.1.3. Μο­ρια­κή κλω­νο­ποί­ηση και χα­ρα­κτη­ρι­σμός του γο­νι­δί­ου RML1
9.7.1.4. Α­που­σί­α κυτ­τα­ρι­κών διαι­ρέ­σε­ων στο με­τάλ­λαγ­μα rml1 λό­γω έλ­λει­ψης εν­δο­γε­νούς γλου­τα­θειό­νης (GSH)
9.7.2. Οι με­ταλ­λά­ξεις short root (shr) και scarecrow (scr)
9.7.2.1. Φαι­νο­τυ­πι­κός και μο­ρια­κός χα­ρακτη­ρι­σμός της με­τάλ­λα­ξης short root (shr)
9.7.2.2. Φαι­νο­τυ­πι­κός και μο­ρια­κός χα­ρα­κτη­ρι­σμός της με­τάλ­λα­ξης scarecrow (scr)
9.7.2.3. Αλ­λη­λε­πί­δρα­ση SHR/SCR - Α­κτι­νω­τή με­τα­γω­γή σι­νιά­λου
9.7.3. Η με­τάλ­λα­ξη fass (fs)
9.8. ΤΟ ΠΡΟΤΥΠΟ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΣΗΣ ΤΩΝ ΕΠΙΔΕΡΜΙΚΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ ΤΗΣ ΡΙΖΑΣ ΣΤΟ ΦΥΤΟ ARABIDOPSIS
9.9. ΤΥΠΟΙ ΕΠΙΔΕΡΜΙΚΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ
9.10. ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΟΣ ΡΙΖΙΚΩΝ ΤΡΙΧΙΔΙΩΝ
9.11. ΜΟΡΙΑΚΗ ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΤΗΣ ΜΟΡΦΟΓΕΝΕΣΗΣ ΤΩΝ ΡΙΖΙΚΩΝ ΤΡΙΧΙΔΙΩΝ
9.11.1. Τρι­χο­βλά­στης ή Α­τρι­χο­βλά­στης; Γο­νί­δια που κα­θο­ρί­ζουν τη μοί­ρα των ε­πι­δερ­μι­κών κυτ­τάρων ..
9.11.2. Μο­ρια­κός μη­χα­νι­σμός μορ­φο­γέ­νε­σης των ρι­ζι­κών τρι­χι­δί­ων
9.11.3. Γο­νί­δια που κα­θο­ρί­ζουν το πλά­τος της προ­εκ­βο­λής του ρι­ζι­κού τρι­χι­δί­ου
9.11.4. Γο­νί­δια που κα­θο­ρί­ζουν την ε­πιμή­κυν­ση του ρι­ζι­κού τρι­χι­δί­ου
9.11.5. Γο­νί­δια που α­πο­τρέ­πουν τη διακλά­δω­ση του ρι­ζι­κού τρι­χι­δί­ου
9.11.6. Γο­νί­δια που κα­θο­ρί­ζουν την πο­λι­κό­τη­τα και το ρυθ­μό α­νά­πτυ­ξης του ρι­ζι­κού τρι­χι­δί­ου
9.12. ΜΟΡΙΑΚΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΙ ΕΠΙΔΡΑΣΗΣ ΟΡΜΟΝΩΝ ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΩΝ ΡΙΖΙΚΩΝ ΤΡΙΧΙΔΙΩΝ
9.12.1. Ε­πί­δρα­ση αι­θυ­λε­νί­ου στην α­νά­πτυ­ξη των ρι­ζι­κών τρι­χι­δί­ων
9.13. Ο­ΜΟΙΟΤΗΤΕΣ ΚΑΙ ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΤΟΥ ΕΠΙΔΕΡΜΙΚΟΥ ΠΡΟΤΥΠΟΥ ΜΕΤΑΞΥ ΤΗΣ ΡΙΖΑΣ ΚΑΙ ΤΩΝ ΥΠΟΛΟΙΠΩΝ ΙΣΤΩΝ
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

10 Ο ρόλος των “μικρών” RNA στη μοριακή και αναπτυξιακή βιολογία φυτών

10.1. ΕΙΣΑΓΩΓΗ
10.1.1 RNA σί­γη­ση
10.2 Ε­ΦΑΡΜΟΓΗ ΤΗΣ RNA ΣΙΓΗΣΗΣ ΓΙΑ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΗ ΑΝΑΛΥΣΗ ΓΟΝΙΔΙΩΝ
10.2.1 Βιο­λο­γι­κός Ρό­λος της RNA σί­γη­σης
10.3 ΤΑ miRNA
10.3.1 Βιο­γέ­νε­ση
10.3.2 Δρά­ση των miRNA
10.3.3. Μέ­θο­δοι για τη λει­τουρ­γι­κή α­νά­λυ­ση των miRNA
10.3.4 Ο ρό­λος των miRNA στην α­νά­πτυ­ξη των φυ­τών
10.3.4.1 Τα miRΝΑ στην α­νά­πτυ­ξη του φύλ­λου
10.3.4.2 miRNA στην α­νά­πτυ­ξη του άν­θους
10.3.4.3 miRNA στη με­τά­βα­ση φά­σης
10.3.4.4 miRNA στην α­νά­πτυ­ξη του βλα­στού και των αγ­γεί­ων
10.3.4.5 miRNA στην α­νά­πτυ­ξη της ρί­ζας
10.3.4.6 miRNA στην ορ­μο­νι­κή ρύθ­μι­ση της α­νά­πτυ­ξης
10.4 ΒΙΟΓΕΝΕΣΗ miRNA ΚΑΙ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΦΥΤΩΝ
10.5 ΧΡΗΣΗ ΤΩΝ miRNA ΓΙΑ ΕΞΕΙΔΙΚΕΥΜΕΝΗ ΚΑΤΑΣΤΟΛΗ ΓΟΝΙΔΙΩΝ
10.6 ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑΤΑ - ΠΡΟΟΠΤΙΚΕΣ
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

11 Περιβαλλοντικοί παράγοντες που επηρεάζουν την ανάπτυξη των φυτών

11.1. ΕΙΣΑΓΩΓΗ
11.2. ΓΕΩΤΡΟΠΙΣΜΟΣ
11.2.1. Α­ντί­λη­ψη της Βα­ρύ­τη­τας
11.2.2. Με­τα­γω­γή σή­μα­τος στους στα­τό­λι­θους
11.2.3. Με­τα­γω­γή σή­μα­τος α­πό τους στα­τό­λι­θους στα υ­πό­λοι­πα κύτ­τα­ρα
11.3. ΘΙΓΜΟΜΟΡΦΟΓΕΝΕΣΗ
11.3.1. Πρώ­ι­μες α­πο­κρί­σεις σε μη­χα­νι­κές διε­γέρ­σεις
11.3.2. Τα γο­νί­δια ε­πα­φής
11.3.3. Αι­θυ­λέ­νιο
11.4. Ε­ΠΙΔΡΑΣΕΙΣ ΑΝΩΜΑΛΙΩΝ ΘΡΕΨΗΣ ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΗΣ ΡΙΖΑΣ
11.4.1. Η δια­θε­σι­μό­τη­τα φω­σφό­ρου και η μορ­φο­γέ­νε­ση των ρι­ζι­κών τρι­χι­δί­ων στο φυ­τό Arabidopsis
11.4.2. Η δια­θε­σι­μό­τη­τα α­ζώ­του και η αρ­χι­τε­κτο­νι­κή της ρί­ζας στο φυ­τό Arabidopsis
11.4.3. Το γο­νί­διο ANR1 του φυ­τού Arabidopsis ρυθ­μί­ζε­ται α­πό τα νι­τρι­κά ιό­ντα
11.4.4. Α­πο­κρί­σεις στα νι­τρι­κά ιό­ντα και προ­σαρ­μο­στι­κό­τη­τα
11.5. ΕΑΡΙΝΟΠΟΙΗΣΗ
11.5.1. Α­παι­τή­σεις ε­α­ρι­νο­ποί­η­σης
11.5.2. Α­ντί­λη­ψη του ψύ­χους
11.5.3. Ση­μεί­α α­ντί­λη­ψης του ψύ­χους κα­τά την ε­α­ρι­νο­ποί­η­ση
11.5.4. Δια­τή­ρη­ση της κα­τά­στα­σης ε­α­ρι­νο­ποί­η­σης
11.5.5. Γο­νί­δια και ε­α­ρι­νο­ποί­η­ση
11.5.6. Ε­ξέ­λι­ξη οι­κο­τύ­πων Arabidopsis που δεν έ­χουν α­νά­γκη την ε­α­ρι­νοποί­η­ση
11.6. ΘΕΡΜΟΓΕΝΕΣΗ - ΘΕΡΜΟΡΥΘΜΙΣΗ
11.6.1. Το φαι­νό­με­νο της θερ­μο­γέ­νε­σης
11.6.2. Μο­ρια­κός μη­χα­νι­σμός θερ­μο­γέ­νε­σης
11.6.3. Θερ­μο­ρύθ­μι­ση στα άν­θη των θερ­μο­γε­νών φυ­τών
11.7. Α­ΝΤΙΛΗΨΗ ΤΟΥ ΦΩΤΟΣ
11.8. ΦΥΤΟΧΡΩΜΑΤΑ
11.8.1. Δο­μή του φυ­το­χρώ­μα­τος
11.8.2. Φω­το­α­να­στρο­φή - Φω­το­με­τα­τρο­πή - Σκο­το­α­ναστρο­φή
11.8.3. Τύ­ποι φυ­το­χρω­μά­των και ο­νο­μα­το­λο­γί­α
11.8.4. Αυ­το­φω­σφο­ρυ­λί­ω­ση του φυ­το­χρώ­μα­τος και εν­δο­κυτ­τα­ρι­κή κα­τα­νο­μή
11.8.5. Ε­ντο­πι­σμός του φυ­το­χρώ­μα­τος
11.9. Η ΕΠΙΔΡΑΣΗ ΤΟΥ ΦΥΤΟΧΡΩΜΑΤΟΣ ΣΤΙΣ ΦΩΤΟΜΟΡΦΟΓΕΝΕΤΙΚΕΣ ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΙΣ
11.9.1. Λαν­θά­νου­σα πε­ρί­ο­δος - Χρό­νος δια­φυ­γής
11.9.2. Κα­τη­γο­ρί­ες φω­το­μορ­φο­γε­νε­τι­κών α­ντι­δρά­σεων
11.9.3. Α­ντι­δρά­σεις πο­λύ α­σθε­νούς φω­τει­νής ε­πί­δρασης (VLFRs)
11.9.4. Α­ντι­δρά­σεις α­σθε­νούς φω­τει­νής ε­πί­δρα­σης (LFRs)
11.9.5. Α­ντι­δρά­σεις υ­ψη­λής διάρ­κειας φωτει­νής ε­πί­δρα­σης (HIRs)
11.10. ΚΡΥΠΤΟΧΡΩΜΑΤΑ
11.11. Η ΠΡΩΤΕΪΝΗ NPH1
11.12. Α­ΝΑΠΤΥΞΙΑΚΕΣ ΑΠΟΚΡΙΣΕΙΣ ΣΤΟ ΦΩΣ
11.13. ΕΠΙΔΡΑΣΗ ΣΤΗ ΒΛΑΣΤΙΚΟΤΗΤΑ ΤΩΝ ΣΠΕΡΜΑΤΩΝ
11.13.1. Χα­ρα­κτη­ρι­σμός με­ταλ­λά­ξε­ων στο σύ­στη­μα του φυ­το­χρώ­μα­τος
11.13.2. Αλ­λη­λε­πί­δρα­ση φυ­τοχρω­μά­των και γι­ββε­ρε­λλι­νών
11.14. ΣΚΟΤΟ- ΚΑΙ ΦΩΤΟ- ΜΟΡΦΟΓΕΝΕΣΗ
11.14.1. Μη­χα­νι­σμοί α­ντί­ληψης των φω­τει­νών ε­ρε­θι­σμά­των
11.14.2. Αρ­νη­τι­κοί ρυθ­μι­στές της φω­το­μορ­φο­γέ­νε­σης
11.14.3. Το πρω­τε­ϊ­νι­κό σύ­μπλεγ­μα COP9
11.14.4. Η πρω­τε­ΐ­νη COP1
11.14.5. Ορ­μο­νι­κά σι­νιά­λα
11.15. ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΗ ΣΗΜΑΣΙΑ ΤΩΝ ΦΥΤΟΧΡΩΜΑΤΩΝ: ΑΠΟΦΥΓΗ ΣΚΙΑΣΗΣ
11.15.1. Ο λό­γος R : FR
11.15.2. Ο λό­γος Pfr/ Pο­λι­κό- Η­λιό­φυ­τα & Σκιό­φυ­τα
11.15.3. Α­ντί­λη­ψη της ποιό­τητας του φω­τός
11.15.4. Με­τα­γω­γή σή­μα­τος
11.16. ΦΩΤΟΤΡΟΠΙΣΜΟΣ
11.16.1. Α­ντί­λη­ψη φω­τός και με­τα­γω­γή σήμα­τος στο φω­το­τρο­πι­σμό
11.17. ΦΩΤΟΠΕΡΙΟΔΙΚΟΣ ΕΛΕΓΧΟΣ ΤΗΣ ΑΝΘΗΣΗΣ
11.17.1. Α­παι­τή­σεις σε φω­τοπε­ρί­ο­δο
11.17.2. Χρο­νο­μέ­τρη­ση της φωτο­πε­ριό­δου
11.17.3. Το κιρ­κα­δια­νό ρο­λό­ι ρυθ­μί­ζει τη φω­το­πε­ριο­δι­κή α­πό­κρι­ση
11.17.4. Α­ριθ­μός των φω­το­περιο­δι­κών ε­πα­γω­γι­κών κύ­κλων & Φω­το­πε­ριο­δι­κή ευαι­σθη­σί­α
11.17.5. Φω­το­δέ­κτες που συμ­με­τέ­χουν στη φω­το­πε­ριο­δι­κή α­πό­κρι­ση
11.17.6. Η με­τά­βα­ση στην κα­τάστα­ση άν­θη­σης κα­θο­ρί­ζε­ται α­πό διά­φο­ρους πα­ρά­γο­ντες και α­να­πτυ­ξια­κά μονο­πά­τια
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ (Γε­ω­τρο­πι­σμός)
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ (Θιγ­μο­μορ­φο­γέ­νε­ση)
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ (Ε­πι­δρά­σεις α­νω­μα­λιών θρέ­ψης στην α­νάπτυ­ξη της ρί­ζας)
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ (Εαρινοποίηση)
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ (Θερ­μο­γέ­νε­ση - Θερ­μο­ρύθμι­ση)
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ (Α­ντί­λη­ψη του φω­τός - Σκο­το- & φω­το- μορ­φο­γέ­νε­ση - Φω­το­πε­ριο­δι­κός έ­λεγχος της άν­θη­σης)

12 Επιγενετική στην ανάπτυξη των φυτών

12.1. Ε­ΠΙΓΕΝΕΤΙΚΗ ΡΥΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ ΤΩΝ ΦΥΤΩΝ
12.2. ΜΕ­ΡΙ­ΚΑ ΦΑΙ­ΝΟ­ΜΕ­ΝΑ Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗΣ
12.3. ΔΟ­ΜΗ ΤΗΣ ΧΡΩ­ΜΑ­ΤΙ­ΝΗΣ, ΤΡΟ­ΠΟ­ΠΟΙ­Η­ΣΗ ΚΑΙ ΡΥΘ­ΜΙΣΗ ΤΗΣ ΕΚ­ΦΡΑ­ΣΗΣ
12.4. ΜΕ­ΘΥ­ΛΙΩ­ΣΗ ΚΑΙ Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙΚΗ Α­ΝΑ­ΠΤΥ­ΞΙΑ­ΚΗ ΡΥΘ­ΜΙ­ΣΗ ΣΤΑ ΖΩ­Α
12.4. LAMARCK VS DARWIN
12.5. ΜΕ­ΘΥ­ΛΙΩ­ΣΗ ΤΟΥ DNA
12.6. ΤΑ ΓΟ­ΝΙ­ΔΙΑ ΜΑ­ΘΑΙ­ΝΟΥΝ Ε­ΜΠΕΙ­ΡΙ­ΚΑ Α­ΠΟ ΜΟ­ΝΑ ΤΟΥΣ
12.7. Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗ ΚΑΙ ΚΛΗ­ΡΟ­ΝΟ­ΜΙ­ΚΟ­ΤΗ­ΤΑ
12.8. ΤΑ ΦΥ­ΤΑ ΠΑ­ΝΩ ΣΤΟ ΣΥ­ΝΕ­ΧΩΣ ΔΙΑ­ΜΟΡ­ΦΟΥ­ΜΕ­ΝΟ ΠΛΑΙ­ΣΙΟ ΤΗΣ Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗΣ
12.9. ΣΙΓΗΣΗ ΜΕ ΤΗ ΔΙΑ­ΜΕ­ΣΟ­ΛΑ­ΒΗ­ΣΗ ΤΟΥ RNA
12.10. Ε­ΠΙ­ΚΟΙ­ΝΩ­ΝΙΑ ΤΗΣ ΣΙΩ­ΠΗ­ΛΗΣ ΠΛΗ­ΡΟ­ΦΟ­ΡΙΑΣ
12.11. ΤΟ ΚΑ­ΛΑ­ΜΠΟ­ΚΙ, Ε­ΝΑΣ ΟΡ­ΓΑ­ΝΙ­ΣΜΟΣ ΜΕ ΠΛΟΥ­ΣΙΑ Ι­ΣΤΟ­ΡΙΑ ΣΤΗΝ Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗ
12.12. ΤΟ Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΟ ΠΕ­ΔΙΟ ΣΤΟ ΦΥ­ΤΟ ARABIDOPSIS
12.13. Η χρο­νι­κή πε­ρίο­δος και η α­νάπτυ­ξη ε­πη­ρε­ά­ζουν τη σιγη­ση
12.14. ΤΡΟ­ΠΟ­ΠΟΙ­Η­ΜΕ­ΝΕΣ Ι­ΣΤΟ­ΝΕΣ ΚΑΙ Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗ ΡΥΘ­ΜΙ­ΣΗ ΤΗΣ ΕΚ­ΦΡΑ­ΣΗΣ ΓΟ­ΝΙΔΙΩΝ
12.15. Ε­ΠΙ­ΓΕ­ΝΕ­ΤΙ­ΚΗ, ΠΡΟ­ΣΑΡ­ΜΟ­ΣΤΙ­ΚΟ­ΤΗ­ΤΑ ΚΑΙ Ε­ΞΕ­ΛΙΞΗ
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ
Περαιτέρω αναφορές για τις εικόνες
ΕΥΡΕΤΗΡΙΟ